O Campeonato Carioca 2013 já chegou ao fim e teve o Botafogo como campeão, de forma antecipada, já que o clube levou o caneco dos dois turnos do torneio. No entanto, ainda há pendências a serem resolvidas no Tribunal de Justiça Desportiva do Rio de Janeiro (TJD/RJ). Na última quinta-feira, dia 23 de maio, o mandado de garantia interposto pelo Flamengo, que pedia a anulação da partida contra o Duque de Caxias, realizada no dia 6 de abril, pela Taça Rio, estava na pauta do Pleno. No entanto, como a competição já terminou, o próprio clube desistiu do caso, por conta da perda de interesse processual.

Com o fim do campeonato, os auditores do Pleno apenas homologariam a perda do objeto do mandado. Mas não precisou, já que o Flamengo desistiu do caso. No dia 17 de março, o presidente do TJD/RJ concedeu a liminar ao clube, determinando a não homologação do resultado da partida contra o Duque de Caxias, que ficou empatada em 1 a 1, em Moça Bonita.

Além disso, no dia 10 de abril, o Flamengo também entrou com o pedido de abertura de inquérito para apurar a conduta do árbitro Pathrice Maia, que anulou o gol de Hernane no segundo tempo, após validar o lance. Após conversar com o assistente que fica na linha de fundo, o árbitro optou por marcar impedimento e anulou o tento, 40 segundos depois de tê-lo confirmado.

Com isso, os árbitros foram convocados para prestarem esclarecimentos no dia 25 de abril e, após análise dos depoimentos, o relator do caso, José Jayme de Souza Santoro, decidiu arquivar o processo, afirmando que não houve interferência externa para a decisão do árbitro.

Na Taça Rio, o Flamengo terminou em terceiro lugar do Grupo B, sem conseguir chegar à semifinal da competição. Na classificação geral do Campeonato Carioca, o Rubro-Negro ficou na segunda posição, três pontos atrás do campeão Botafogo. O time comandado por Jorginho teve o atacante Hernane como artilheiro do torneio e o gol de Rafinha, contra o Friburguense, eleito o mais bonito.