O Fluminense lida no momento com salários atrasados. O pagamento da folha salarial de todo o clube, em torno de R$ 2,1 milhões, deveria ter sido feito há dez dias. O problema foi agravado pela recente penhora dos direitos econômicos do atacante Wellington Nem, promovida por ação da Procuradoria da Fazenda Nacional. A negociação havia sido a forma encontrada para superar outras penhoras em cima das receitas da instituição.

- No momento, os salários estão atrasados. Os mais altos estão assim. Os menores, das pessoas que dão base ao clube, como portaria, limpeza, esses estão em dia. Separamos a folha no momento em que sabíamos que corríamos o risco de ocorrer algum atraso, alguma crise. Nesses dois anos e meio de gestão, tivemos apenas dois momentos assim - afirmou o diretor executivo geral do Fluminense, Jackson Vasconcellos, em entrevista ao LANCE!Net.
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O presidente do Fluminense, Peter Siemsen, foi até Brasília (DF) para conversar com a Advocacia Geral da União (AGU) e representantes do Ministério da Fazenda, a fim de apresentar uma solução para o pagamentos das dívidas. Os menores salários da folha estão em dia e os maiores vencimentos, atrasados. Parte do elenco do departamento de futebol recebe diretamente da principal patrocinadora, a Unimed-Rio. Estes não entram na conta do clube. Ainda não há previsão para a solução do problema, mas a diretoria tem feito todos os esforços ao alcance para resolvê-lo.

O Flu tem enfrentado muitas dificuldades financeiras em consequência das penhoras sobre as cotas de TV (no valor de aproximadamente R$ 3 milhões mensais) e as fracas receitas de bilheteria no ano. Por isso ainda não pagou sua parte da premiação aos jogadores pela conquista do Campeonato Brasileiro de 2012. Além disso, o clube foi excluído da Timemania, devido a parcelas deixadas em aberto desde dezembro, decorrentes de problemas para o pagamento.